yangxunscience 发表于 2021-9-30 15:16:49

VASPKIT计算弹性常数批处理脚本问题

各位专家大家好：

            在使用VASPKIT中的脚本计算弹性常数时，直接使用VASPKIT提供的脚本出现计算死机。原因可能是所有应变下的文件夹任务被循环同时提交了。请问如何修改，让一个计算任务结束后再开始另外一个计算？非常感谢！下面是shell脚本的内容。

          #!/bin/bash
          root_path=`pwd`
          for cij in `ls -F | grep /$`
          do
          cd ${root_path}/$cij
          for s in strain_*
          do
          cd ${root_path}/$cij/$s
          echo `pwd`
          mpirun -np 24 /home/w12/Public/vasp.6.1.0/bin/vasp_std > out&
          done
          done

vaspkit 发表于 2021-9-30 15:57:17

vaspkit.1.3具有自动提交作业功能，可以实现批量提交作业，按照下图所列步骤试试。

yangxunscience 发表于 2021-9-30 22:14:15

非常感谢！

yangxunscience 发表于 2021-10-16 21:48:55

vaspkit 发表于 2021-9-30 15:57
vaspkit.1.3具有自动提交作业功能，可以实现批量提交作业，按照下图所列步骤试试。 ...

请问如果单机计算机器中没有安装slurm或者pbs排队软件，如何在shell脚本中设置让VASP计算完一个文件夹后，再开始另外一个文件夹任务的计算呢？非常感谢！

vaspkit 发表于 2021-10-18 14:19:02

你第一次发的那个脚本就可以。

yangxunscience 发表于 2021-10-19 15:51:07

vaspkit 发表于 2021-10-18 14:19
你第一次发的那个脚本就可以。
这个脚本不行，如果执行的话，所有循环的结构的计算会同时运行，导致计算机死机。
我们在命令mpirun -np 24 /home/w12/Public/vasp.6.1.0/bin/vasp_std > out&后加了wait也不行。

波云见天 发表于 2021-10-27 23:29:01

把你的脚本中的&去掉，用nohup ./**.sh &运行就行！

yangxunscience 发表于 2021-11-11 14:01:22

波云见天 发表于 2021-10-27 23:29
把你的脚本中的&去掉，用nohup ./**.sh &运行就行！

非常感谢！
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