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ATOMKIT 0.2.0版本

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发表于 2023-4-26 12:31:59 | 显示全部楼层 |阅读模式
结构导入模块中,已支持导入POSCAR,CIF文件以及根据空间群号和Wyckoff位置建立晶体结构。
能带路径模块中,已支持以下格式输出:
  1. 301) K-Path for ABACUS Code
  2. 302) K-Path for ABINIT Code
  3. 312) K-Path for CASTEP Code
  4. 314) K-Path for CP2K Code
  5. 323) K-Path for ELK Code
  6. 329) K-Path for FHI-aims Code
  7. 351) K-Path for Phonopy Code
  8. 356) K-Path for Quantum-Espresso Code
  9. 368) K-Path for SIESTA Code
  10. 375) K-Path for VASP Code
  11. 380) K-Path for Wannier90 Code
复制代码

结构导出模块中,已支持以下格式输出:
  1. 101) ABACUS (*.stru)
  2. 102) ABINIT (*.in)
  3. 103) CASTEP (*.cell)
  4. 104) CIF Format (*.cif)
  5. 105) CP2K (*.inp)
  6. 106) CPMD (*.inp)
  7. 107) Elk (*.in)
  8. 108) FHI-aims (*.in)
  9. 109) FLEUR (*.inp)
  10. 110) Gaussian (*.gjf)
  11. 111) JDFTx (*.in)
  12. 112) ORCA (*.in)
  13. 113) PDB Format (*.pdb)
  14. 114) Quantum-Espresso (*.in)
  15. 115) RSPt (*.inp)
  16. 116) Siesta (*.fdf)
  17. 117) VASP (*.vasp)
  18. 118) Wannier90 (*.win)
  19. 119) XCrySDen (*.xsf)
  20. 120) XYZ Format (*.xyz)
复制代码

      在后续版本中,我们将不断完善并增加更多的导入和导出结构格式。与此同时,我们非常欢迎您提出宝贵的反馈、改进建议和为我们提供更多的计算模拟软件输入结构格式模板以及详细说明。ATOMKIT软件的安装和使用与其姊妹软件VASPKIT极为相似,二者之间的使用习惯可无缝衔接。未来我们致力于将ATOMKIT打造成一款通用性的晶体结构建模工具箱。需要强调的是,在新版本中导入结构文件时,要求软件对应的ID和读入文件名信息。例如我们想把BiTe.cif文件转化成POSCAR格式,在终端运行atomkit,

  1. ===================== Structural Utilities ======================

  2.   1) Export Structures             2)  Symmetry Analysis
  3.   2) K-Path for Band-Structure     4)  Structure Editor
  4.   3) Advanced Structure Models     6)  2D-Material Kit
  5.   4) Quit
  6.      ------------>>
  7. 1
  8. ===================== Import Format Options =====================
  9.   13) CIF Format (*.cif)
  10.   75) VASP (*.vasp)
  11.   99) Build Crystal from Wyckoff Positions

  12. +---------------------------- Tip ------------------------------+
  13. | Examples of Usage:                                            |
  14. | 13 Si.cif: Read Structure from Si.cif file with cif format    |
  15. | 75 POSCAR: Read Structure from POSCAR file with VASP format   |
  16. | 99 INPUT:  Build Crystal From Wyckoff positions in INPUT file |
  17. +---------------------------------------------------------------+
  18. Please Input the code-ID listed above and the filename to Read:
  19. ------------>>
  20. 13 BiTe.cif
复制代码

输入13 BiTe.cif, 其中13表示要告诉atomkit读入cif格式,文件名为BiTe.cif。回车后生成BiTe.vasp文件。
  1. +---------------------------------------------------------------+
  2. | This utility is in experimental stage & needs to be improved. |
  3. +---------------------------------------------------------------+
  4. +-------------------------- Summary ----------------------------+
  5.             Space Group: 225
  6.          Crystal System: Cubic
  7.       Lattice Constants:   6.470   6.470   6.470
  8.          Lattice Angles:  90.000  90.000  90.000
  9.             Total Atoms:   8
  10. Species & Wyckoff Site: [Bi]  0.000  0.000  0.000
  11. Species & Wyckoff Site: [Te]  0.500  0.500  0.500
  12. +---------------------------------------------------------------+
  13. ===================== Export Format Options =====================

  14.     101) ABACUS (*.stru)
  15.     102) ABINIT (*.in)
  16.     103) CASTEP (*.cell)
  17.     104) CIF Format (*.cif)
  18.     105) CP2K (*.inp)
  19.     106) CPMD (*.inp)
  20.     107) Elk (*.in)
  21.     108) FHI-aims (*.in)
  22.     109) FLEUR (*.inp)
  23.     110) Gaussian (*.gjf)
  24.     111) JDFTx (*.in)
  25.     112) ORCA (*.in)
  26.     113) PDB Format (*.pdb)
  27.     114) Quantum-Espresso (*.in)
  28.     115) RSPt (*.inp)
  29.     116) Siesta (*.fdf)
  30.     117) VASP (*.vasp)
  31.     118) Wannier90 (*.win)
  32.     119) XCrySDen (*.xsf)
  33.     120) XYZ Format (*.xyz)

  34.     0) Quit
  35.     9) Back
  36.          ------------>>
  37.     175

  38. -->> (01) Written BiTe.vasp File!
复制代码
ATOMKIT软件目前仍处于内测阶段,其0.2.0.Linux版本可通过百度网盘下载:https://pan.baidu.com/s/1MCfYAB5IQbrVhEPXvlHXig?pwd=vuuu
若使用VASPKIT软件请引用文献 Computer Physics Communications 267, 108033, (2021) ,您的支持是对我们付出的最大肯定。
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