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有关径向分布函数 RDF

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发表于 2022-8-6 02:50:32 | 显示全部楼层 |阅读模式
我在 vaspkit 官方网站上看到,722 功能是从 MD 的结果中获得 RDF。可是我在 vaspkit1.3.5 的 72 模块中没有看到这个功能。请问 RDF 是某个版本特有的,还是还没有上线?

版本1.3.5

版本1.3.5

72 MD模块,无RDF功能

72 MD模块,无RDF功能
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发表于 2022-8-11 15:25:01 | 显示全部楼层
vaspkit-726功能,不过该功能有瑕疵需完善,当r趋近于很大值RDF未归一。
若使用VASPKIT软件请引用文献 Computer Physics Communications 267, 108033, (2021) ,您的支持是对我们付出的最大肯定。
VASPKIT英文网址https://vaspkit.com, 中文网址http://vaspkit.cn, 中文论坛http://bbs.vaspkit.cn, QQ学术交流群:331895604和498683602, 微信公众号:VASPKIT
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发表于 2022-8-30 20:19:37 | 显示全部楼层
vaspkit 发表于 2022-8-11 15:25
vaspkit-726功能,不过该功能有瑕疵需完善,当r趋近于很大值RDF未归一。

啊哈,我甚至用过这个功能处理过数据,不知道有没有更好的程序来得到RDF这个结果呢,似乎r较小的时候和实验结果吻合的很好
希望有一天能成为照耀他人的光
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发表于 2022-8-30 21:42:45 | 显示全部楼层
RDF功能在1.4.0版本已进一步完善,即RDF(r->∞)=1。
若使用VASPKIT软件请引用文献 Computer Physics Communications 267, 108033, (2021) ,您的支持是对我们付出的最大肯定。
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发表于 2022-8-31 15:10:38 | 显示全部楼层
vaspkit 发表于 2022-8-30 21:42
RDF功能在1.4.0版本已进一步完善,即RDF(r->∞)=1。

好的 非常期待新版本的VASPKIT
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 楼主| 发表于 2022-9-7 00:17:25 | 显示全部楼层
感谢回复!已经用 VASPkit 的对应功能获得了 RDF,峰位没啥问题,只不过r较大时趋于了0而不是1. 期待1.4版本
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 楼主| 发表于 2022-9-7 00:23:34 | 显示全部楼层
另外问一下,1.4版本有大概的发布时间吗
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发表于 2022-9-7 14:39:55 | 显示全部楼层
goldxingxing 发表于 2022-9-7 00:23
另外问一下,1.4版本有大概的发布时间吗

最近一两周。
若使用VASPKIT软件请引用文献 Computer Physics Communications 267, 108033, (2021) ,您的支持是对我们付出的最大肯定。
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发表于 2022-9-25 16:38:16 | 显示全部楼层

期待期待,太需要这个功能了
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发表于 2023-3-19 22:09:54 | 显示全部楼层
Lamed 发表于 2022-8-30 20:19
啊哈,我甚至用过这个功能处理过数据,不知道有没有更好的程序来得到RDF这个结果呢,似乎r较小的时候和实 ...

VMD可能效果比较好,不过得转化成pdb轨迹格式
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