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109 Submit Job Queue功能怎么设置参数?

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发表于 2022-1-7 01:24:26 | 显示全部楼层 |阅读模式
使用109功能提交计算任务时,怎么设置核数、时间等参数?
生成的job.sh默认用pbs吗?如果是slurm能用吗?



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发表于 2022-1-7 08:14:59 | 显示全部楼层
可以用PBS或者slurm等作业管理系统软件提交作业。
第一步:从你自己的vasp.job作业脚本文件的内容拷贝到~/.vaspkit文件中这一部分

  1. #BEGIN_CUSTOMIZE_JOB_SCRIPT
  2. #PBS -N name
  3. #PBS -o out
  4. #PBS -e err
  5. #PBS -l nodes=2:ppn=4
  6. #PBS -r y
  7. cd $PBS_O_WORKDIR
  8. mpirun -np 8 vasp_std > vasp-out
  9. #END_CUSTOMIZE_JOB_SCRIPT
复制代码
第二步:在~/.vaspkit中设置,qsub是提交作业的命令,也可以是bsub,这取决于你们服务器上安装的作业管理系统。
  1. SUBMIT_JOB_COMMAND            =     'qsub job.sh'                  # The command line to submit job
复制代码
第三步:如果想在vaspkit退出时自动提交作业,比如批量提交作业,可在~/.vaspkit中设置以下命令。正常情况下,要设置AUTO_SUBMIT_JOB   =   .FALSE.
  1. AUTO_SUBMIT_JOB                   =     .TRUE.
复制代码


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