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vaspkit得到标准化原胞基矢和pymatgen得到标准化原胞基矢差异

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发表于 2021-10-31 10:47:05 | 显示全部楼层 |阅读模式
请问下,我用vaspkit得到的原胞基矢和采用pymatgen中的方法(这个也是调用的spglib)得到的原胞基矢,这二者的形式有点不一样,这两种是不是都是标准化的原胞基矢呢?

两种基矢差异

两种基矢差异

pymatgen得到标准化基矢原胞

pymatgen得到标准化基矢原胞

使用pymatgen得到具有标准化基矢的原胞

使用pymatgen得到具有标准化基矢的原胞
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发表于 2021-10-31 10:58:54 | 显示全部楼层
VASPKIT首先调用spglib寻找到标准的惯用晶胞,然后基于文献Computational Materials Science 128 (2017) 140–184中的表3所给出的变换矩阵P,通过公式原胞基矢(ap, bp, cp)=晶胞基矢(ac, bc, cc)*P得到原胞(参考https://spglib.github.io/spglib/definition.html)。VASPKIT能带路径生成基于文献Computational Materials Science 128 (2017) 140–184给出的算法,和seekpath软件相同,而pymatgen的基于Computational Materials Science 49 (2010) 299–312。两篇文献所给出的个别晶系变换矩阵定义有所不同。
若使用VASPKIT软件请引用文献 Computer Physics Communications 267, 108033, (2021) ,您的支持是对我们付出的最大肯定。
VASPKIT英文网址https://vaspkit.com, 中文网址http://vaspkit.cn, 中文论坛http://bbs.vaspkit.cn, QQ学术交流群:331895604和498683602, 微信公众号:VASPKIT
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