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STM模拟

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发表于 2023-2-15 10:32:03 | 显示全部楼层 |阅读模式
老师能详细介绍一下关于STM模拟这三个选项都是什么意思嘛?




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发表于 2023-2-15 17:58:43 | 显示全部楼层
第1个是STM模式,第2个是离表面的距离,第3个是STM图重复单元,类似于超胞图。
若使用VASPKIT软件请引用文献 Computer Physics Communications 267, 108033, (2021) ,您的支持是对我们付出的最大肯定。
VASPKIT英文网址https://vaspkit.com, 中文网址http://vaspkit.cn, 中文论坛http://bbs.vaspkit.cn, QQ学术交流群:331895604和498683602, 微信公众号:VASPKIT
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 楼主| 发表于 2023-2-16 08:49:01 | 显示全部楼层
vaspkit 发表于 2023-2-15 17:58
第1个是STM模式,第2个是离表面的距离,第3个是STM图重复单元,类似于超胞图。 ...

哦哦,老师我想测试二维材料的话,一般选择衡高模式是不是就可以了?还有一个问题是距离样品表明多高算合适呀?我看vaspkit-example里关于石墨烯的例子有测试很多距离,从0.5-1.1,那么我到底该选择哪个距离下的STM图像呢?
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发表于 2023-2-16 13:45:42 | 显示全部楼层
找一些相关的文献看看,如PRL 103, 057202 (2009)、Sci Data 8, 57 (2021)等等。
若使用VASPKIT软件请引用文献 Computer Physics Communications 267, 108033, (2021) ,您的支持是对我们付出的最大肯定。
VASPKIT英文网址https://vaspkit.com, 中文网址http://vaspkit.cn, 中文论坛http://bbs.vaspkit.cn, QQ学术交流群:331895604和498683602, 微信公众号:VASPKIT
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 楼主| 发表于 2023-2-16 14:31:19 | 显示全部楼层
vaspkit 发表于 2023-2-16 13:45
找一些相关的文献看看,如PRL 103, 057202 (2009)、Sci Data 8, 57 (2021)等等。

谢谢老师推荐~
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 楼主| 发表于 2023-2-17 09:11:49 | 显示全部楼层
本帖最后由 wkq 于 2023-2-17 11:00 编辑

关于使用 vaspkit 模拟 STM 中高度的设置和 xy 平面设置的建议:Please note that plane-wave codes like VASP will not accurately describe the exponential decay of the wave functions far away from the atoms, and wave functions may need to be extrapolated in order for STM simulations at large heights such as 7Å else it can show unphysical efects. Hence, we choose image height relatively close to surface. All the STM images are made at least 20Å long in the xy plane by repeating the primitive unit cell. We choose height 2Å above the surface (maximum of z-coordinate) during the simulations.(摘自:Sci Data 8, 57 (2021))具体可参考知乎回答:https://zhuanlan.zhihu.com/p/606466586?
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 楼主| 发表于 2023-2-21 12:10:24 | 显示全部楼层
vaspkit 发表于 2023-2-16 13:45
找一些相关的文献看看,如PRL 103, 057202 (2009)、Sci Data 8, 57 (2021)等等。

老师您好,我还想请教一下 VASP 最后计算生成的 PARCHG 文件和我选择什么样的泛函有关吗?比如我用PBE 和 HSE 算出来的 PARCHG 文件是否包含的信息一样?最后的 STM 一样不?
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