caicaiya 发表于 2021-9-22 21:13:37

能否计算AIMD过程的化学键浓度变化？

RT，vasp跑了20PS的AIMD，现在希望得到Fe-O键数量（浓度）的变化（Fe-O/与O有关的键），查找了论文，论文中给出的公式看不太明白，请问vaspkit能否得到呢？或者其他软件也可以？

vaspkit 发表于 2021-9-23 08:14:51

可能需要自己编程实现，首先读入XDATCAR文件，循环计算每一帧里各类化学键的数量，写代码不是那么难。

liuzh 发表于 2023-3-19 22:20:44

给定了公式，需要编程，需要提取XDATCAR的轨迹文件进行分析
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