成华图书馆 发表于 2023-10-27 11:19:04

关于726功能的问题

在AIMD后,使用726功能计算选定两种元素之间的平均PCF。发现当计算的原子数量比较少或者考虑的帧数比较少时可以正常计算,当考虑的原子较多时则会报错(我自己原子数是30个氢和100个V),如图所示。目测可能是内存不够导致的bug,请问该问题如何解决,vaspkit可以提交到超算上进行计算吗?谢谢!

vaspkit 发表于 2023-10-27 11:36:14

在终端运行ulimit -s unlimited后再试试。如果不允许前台运行,可以提交串行作业脚本,可能需要通过bash管道传递输入参数。

成华图书馆 发表于 2023-10-27 15:50:01

vaspkit 发表于 2023-10-27 11:36
在终端运行ulimit -s unlimited后再试试。如果不允许前台运行,可以提交串行作业脚本,可能需要通过bash管 ...

非常感谢您的回复,但是在提交至集群并行计算时,仍然会出现以下报错,请问是什么原因?
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