goldxingxing 发表于 2022-11-8 00:46:37

关于vaspkit.1.4.0 RDF功能

如题，我在用 vaspkit.1.4.0 处理 AIMD 时，经常遇到段错误和内存不足的，例如下图是处理纯水时的报错（段错误）。体系相关信息：

Simulation box:   12.5 Å×12.5 Å×12.5 Å
Number of atoms: 195 atoms (65 H2O molecules)
Steps: NSW=      20000
VASPKIT: cutofff distance=15, bin=0.01

类似的错误之前1.3.5版本中并未出现（当然1.3.5也有问题，r→∞ RDF 没有收敛到1）。测试发现减小 cutofff distance，增大 bin 可避免报错，但是对于一些体系，cutoff distance 无法设置较小。而且为了获得较为准确的 RDF 锋位，bin不能设置的太大。请问有啥解决办法吗

vaspkit 发表于 2022-11-8 09:09:31

在终端运行ulimit -s unlimited再试试。http://bbs.vaspkit.cn/forum.php?mod=viewthread&tid=6&highlight=174

goldxingxing 发表于 2022-11-9 00:39:00

您好，我试过了（和之前同样的体系），还是会有相同的报错

goldxingxing 发表于 2022-12-13 09:33:12

请问有啥解决的办法吗？还是之前同样的体系，我在获取 MSD 时也会同样报错（是因为原子数太多了吗？）
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