yang 发表于 2022-8-22 10:44:42

vaspkit计算扩散系数求助

新手第一次用vasp跑MD计算扩散系数，想请问一下有没有详细的vaspkit处理教程啊:hug:

vaspkit 发表于 2022-8-26 07:16:34

(1) 先用721或722得到MSD.dat，MSD随时间应接近线性变化，接下来调用723得到DIFFUSION_COEFFICIENT.dat ，扩散系数实际上是MSD斜率除一个与维度有关的比例系数。算法原理可参考https://docs.mdanalysis.org/2.0.0/documentation_pages/analysis/msd.html。

https://docs.mdanalysis.org/2.0.0/_images/msd_demo_plot.png
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